EvoDevoSigNet offers an online course prefernetially for members of the network. The course will be held 23-25 of June, directed by the IBVF node. Contents (in Spanish) include:

Curso Práctico en Análisis Evolutivo y Comparativo de Genomas en el Linaje Verde

1. Bases de datos genómicos de organismos vegetales, linaje verde o viridiplantae.

2. Identificación de ortogrupos con Orthofinder. Exploración de los resultados.

3. Orthofinder para análisis masivos, precomputación de ortogrupos y asignación posterior.?

4. Datación de un árbol de especies basada en evidencia fósil en bases de datos usando R.

5. Identificación de eventos de ganancia o pérdida significativas en familias génicas con CAFE.

6. Reconstrucción de estados ancestrales de conjuntos génicos con CAFE.

7. Identificación rápida de secuencias proteicas contra genomas completos usando DIAMOND.

8. Inferencia bayesiana de un gran número de árboles usando Exabayes.

9. Métricas comparativas para árboles filogenéticos: Robinson-Foulds y otras.

10.Casos de estudio: Diversidad, conservación y divergencia de la marca H3K27me3 y de los ritmos circadianos de expresión génica en el linaje verde.